時は元治元年。
黒船来航より、十一年の年月が流れていた。

1864年、動乱の幕末。時代を守るか変えるか、剣を持つ者は二つに分かれ激しく戦っていた。倒幕派を率いる長州藩の桂小五郎のもと、影の暗殺者である緋村抜刀斎こと緋村剣心は暗躍していた。ある夜酒処で助けた若い女との出会いが、剣心の運命を大きく変える――!?　前作「The Final」で描かれたシリーズ最恐の敵・縁との究極の戦い。その戦いの理由となった剣心の頬に刻まれた〈十字傷〉と、剣心が斬殺したという妻・雪代巴の存在に迫る「The Beginning」が待望の公開！　剣心はなぜ〈不殺の誓い〉を立てたのか？　そしてなぜ妻を斬殺しなければならなかったのか？　剣心の原点が明かされる時空を超えたアクション感動超大作後編、最速小説化!!